Por ejemplo para el caso de Armillaria se ha visto que hay un individuo que ocupa 965 ha y tiene una edad estimada de 1500 años.
Supongo que habrán hecho estimaciones a partir de observaciones. Si la Armillaria en ese clima-suelo-hospedante crece tantos m2/año..., viendo los árboles afectados en una misma zona por ese mismo individuo (con un determinado ADN) se puede ver la extensión. Así conociendo la tasa estimada de crecimiento nos dará una edad aproximada.
Por muy exactos que sean las estimaciones no se puede saber a ciencia la edad, ya que hay muchos factores que no se tienen en cuenta.
En el caso de otros hongos (sobretodo micorrícicos) desconozco cómo se puede medir la edad.
Saludos